肠微生物组的时间稳定性及其与牛肉牛的性能特征的纵向关联

科学领域:

• 鲁门微生物组研究
• 动物科学动物科学
• 微生物生态学 微生物生态学

背景情况:

• 体微生物组研究通常依赖于单一时间点样本,这引发了关于时间稳定性和数据可靠性的问题.
• 了解肠微生物群的时间动态对于验证单样研究的结果至关重要.

研究的目的:

• 在牛群中,在长达7个月的生长-完成阶段中,研究肠微生物组的时间稳定性.
• 确定稳定的核心微生物组,并评估其与宿主生产特征和遗传变异的关联.

主要方法:

• 在整个长达7个月的生长-完成期内,在6个时间点收集了反液样本.
• 在分类学 (基因) 和功能 (KEGG基因) 档案中分析了肠微生物组的时间稳定性.
• 与宿主性能特征的表型和遗传变异相关的稳定微生物组概况.

主要成果:

• 鉴定了一种暂时稳定的核心菌微生物组,包括515个属和417个KEGG基因.
• 稳定的微生物组形状与关键生产特征 (例如,平均每日增益,料摄入量,甲排放) 密切相关,解释了显著的表型变化 (45-83%).
• 体微生物组概况解释了牛特征的大量遗传变异 (54-87%),表明存在强烈的宿主微生物组遗传联系.

结论:

• 在屠宰前7个月的时间内,可以识别和可靠地取样暂时稳定的核心肠微生物群.
• 这种稳定的微生物组准确地预测了宿主在表型和遗传层面上的表现.
• 研究结果支持使用一次性牛微生物群采样来预测牛的表现,并为繁殖策略提供信息.