在结直肠癌中开发生存预测模型,使用全表观基因组范围的全血DNA甲基化数据

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 遗传学 遗传学 是一个
• 生物标志物 生物标志物

背景情况:

• 全基因组关联研究确定结直肠癌 (CRC) 生存预测因素.
• 血液DNA甲基化 (血液-DNAm) 对临床特征对于CRC生存预测的附加值是不确定的.

研究的目的:

• 评估将血液mDNA纳入临床特征的好处,以预测CRC患者的存活率.
• 为了比较临床特征,血液-mDNA及其组合的预测性能.

主要方法:

• 一项基于多个地点的人口的队列研究,对2116名CRC患者进行了基线血液-mDNA数据.
• 极端梯度提升与5倍的嵌套离开地点的交叉验证被用于生存预测分析.
• 用时间依赖的ROC曲线和校准来评估模型性能.

主要成果:

• 基于临床特征的预测特征在预测CRC存活率方面超过了血液DNAm特征.
• 与单独的临床特征相比,将血液-mDNA纳入并没有显著改善生存预测.
• 确定M1阶段,血液采集时的年龄和N2阶段是预测的关键因素.

结论:

• 血液DNA甲基化具有一些预后价值,但不提高CRC患者的生存预测超出已确定的临床特征.
• 临床特征仍然是预测结直肠癌患者生存率的主要驱动因素.