用于监测土壤传播的虫的土壤监测:在三个国家的方法开发和实地测试
Malathi Manuel1, Heather K Amato2, Nils Pilotte3
1The Wellcome Trust Research Laboratory, Division of Gastrointestinal Sciences, Christian Medical College Vellore, Vellore, Tamil Nadu, India.
PLoS neglected tropical diseases
|September 6, 2024
概括
使用分子方法进行土壤监测,为检测土壤传播的虫 (STH) 提供了传统便样本分析的经济有效的替代方案. 这种方法显示了土壤和人类感染中的STH之间的强烈关联,有助于监测和控制策略.
科学领域:
- 环境科学环境科学
- 分子生物学分子生物学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 土壤传播的虫 (STH) 感染了全球五分之一的人口.
- 大规模药物管理 (MDA) 是一种常见的控制策略,但监控是具有挑战性的.
- 目前的STH检测方法缺乏灵敏度,特别是在低患病率的环境中.
研究的目的:
- 开发一种敏感和特定的分子方法来检测土壤中的STHDNA.
- 将分子检测与传统显微镜进行比较.
- 评估土壤中的STH与人类感染之间的关联.
主要方法:
- 开发了20g土壤的DNA提取协议.
- 使用定量PCR (qPCR) 和数字滴滴PCR (ddPCR) 进行STH检测.
- 从肯尼亚,贝宁和印度的家庭收集了便和土壤样本.
主要成果:
- 在土壤中通过qPCR的STH流行率:31%A. lumbricoides,3%T. trichiura,13%虫.
- qPCR和ddPCR表现相似. qPCR和ddPCR的表现相似. qPCR和ddPCR的表现相似.
- 分子方法揭示了与显微镜的差异一致,低估了一些STH患病率.
- 在土壤中检测到的STH与家庭成员感染有很强的相关性.
结论:
- 土壤监测比基于便的方法有好处,包括成本更低,成功率更高.
- 使用分子方法进行环境监测是用于STH监测的可行,具有成本效益的战略.
- 这种方法可以补充社区一级的MDA交付,以更好地控制STH.
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