IncN等离子体pKM101的结合转移是由TraK辅助因子和TraI放松酶之间的动态相互作用介导的
Yang Grace Li1, Annika Breidenstein2,3, Ronnie P-A Berntsson2,3
1Department of Microbiology and Molecular Genetics, McGovern Medical School at UTHealth Houston, TX, USA.
细菌结合是传播移动遗传元素 (MGE) 的关键机制,它依赖于蛋白质相互作用. 这项研究揭示了TraK蛋白如何招募TraI放松酶来启动DNA转移,这是MGE传播的关键步骤.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 细菌的结合促进了移动遗传元素 (MGE) 的传播.
- 在转移起源 (oriT) 的放松组组合是结合的初始步骤.
- 放松酶对ORIT的招募至关重要,但尚未完全理解.
研究的目的:
- 为了阐明在放松体组装过程中放松酶招募的分子机制.
- 定义在oriT序列上的TraK和TraI蛋白之间的相互作用.
- 为了了解控制结合性DNA转移的早期事件.
主要方法:
- 阿尔法折叠蛋白质结构预测
- 亲和力拉下测试试验
- 在体内进行现场指导的光交联实验.
主要成果:
- TraK 蛋白通过 TraI 的 C 端域和 TraK 的四聚化域之间的相互作用,将 TraI 放松酶招募到 oriT 序列中.
- 这种相互作用是动态的,在放松体组装时会发生变化.
- 在组装后,TRAI的C端域会自我关联,从而实现催化活动.
结论:
- 这些发现揭示了在细菌结合中放松酶招募和激活的新机制.
- 这项研究阐明了MGE结合性传播的关键早期步骤.
- 已确定的蛋白质-DNA相互作用对于启动横向基因转移至关重要.
更多相关视频
08:21Site-specific Bacterial Chromosome Engineering: ΦC31 Integrase Mediated Cassette Exchange (IMCE)
Published on: March 16, 2012
11:36Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri
Published on: September 23, 2017
相关概念视频
Overview of Transposition and Recombination
LTR Retrotransposons
The internal coding region of LTR retrotransposons and their mechanism of transposition closely resembles a...
Cotranslational Protein Translocation
Sec61 channel partners for cotranslational translocation
During cotranslational translocation, the Sec61 channel partners with the signal recognition particle (SRP), the signal recognition particle receptor (SR), and the ribosomes to transport the nascent polypeptide chain...
DNA-only Transposons
The donor site from where the transposon is excised is either degraded or...
Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation
The recognition sites for Cre recombinase called LoxP...
Transcription Attenuation in Prokaryotes
There are several different mechanisms used to attenuate transcription. In ribosome mediated...
