SARS-CoV-2 变种可能会影响唾液RT-PCR 试验敏感性
Jason S Chwa1,2, Yunho Shin2, Yesun Lee3
1Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California, United States.
The journal of applied laboratory medicine
|September 9, 2024
概括
检测SARS-CoV-2的唾液测试比鼻抽样更不敏感,特别是在无症状病例和Omicron变种中. 然而,随着Delta变种感染和有症状的个体,敏感性增加,突出显示需要持续评估基于唾液的COVID-19检测方法.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 诊断测试 诊断测试 诊断测试
背景情况:
- 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒-2 (SARS-CoV-2) 变种在呼吸道内表现出多样化的热带性.
- 基于唾液的逆转录聚合酶连锁反应 (RT-PCR) 提供了一个方便且具有成本效益的替代性鼻拭片 (NPS).
- 有限的研究存在于不同SARS-CoV-2变种的唾液测试灵敏度.
研究的目的:
- 调查基于唾液的RT-PCR对检测SARS-CoV-2不同变异的敏感性.
- 为了比较症状和无症状个体之间的唾液敏感性.
- 确定影响唾液检测SARS-CoV-2检测准确性的因素.
主要方法:
- 来自有症状或暴露个体的配对NPS和唾液样本使用SARS-CoV-2 RT-PCR进行了测试.
- 病毒基因组测序确定了感染SARS-CoV-2的变种.
- 唾液敏感性与NPS阳性RT-PCR结果相对确定,并进行统计分析.
主要成果:
- 总体上,唾液敏感度为61.7%,在Delta变种感染期间 (79.6%) 与Delta前 (58.5%) 和Omicron (61.5%) 变种相比,观察到更高的敏感度.
- 唾液敏感性在所有变种的有症状的个体中显著更高 (例如,Omicron的78.7%),而不是无症状的病例 (例如,Omicron的51.2%).
- 德尔塔变种感染,症状的存在和高NPS病毒载量独立地与呈阳性唾液RT-PCR结果的几率增加有关.
结论:
- 基于唾液的RT-PCR对SARS-CoV-2的敏感性因变种和症状状况而异.
- 德尔塔变种和症状感染与更高的唾液测试敏感性有关.
- 随着新变种的出现,对唾液检测的持续评估对于有效检测SARS-CoV-2至关重要.
