在安大略省从2016年到2018年使用全基因组测序对抗阿兹罗密辛的Shigella flexneri2a血清型分离物的表征

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 由Shigella flexneri引起的石病是全球范围内一个重大的公共卫生问题.
• 增加的抗菌素耐药性,特别是对阿齐思罗米和西普罗夫洛克萨等一线治疗方法的耐药性,复杂化了石格洛氏病的管理.
• 之前的报道显示,与新兴趋势相比,加拿大和美国的抗药率较低.

研究的目的:

• 分析2016-2018年安大略省Shigella flexneri血清型2a分离物的抗菌素耐药性模式.
• 调查抗阿齐思罗密素耐药的Shigella flexneri 2a.的遗传基础和传播动态.
• 确定与多药耐药性石病爆发相关的潜在风险因素和传播途径.

主要方法:

• 在2016年至2018年期间在安大略省收集的Shigella flexneri血清型2a分离物的回顾性分析.
• 对抗菌素敏感性测试阿齐思罗米辛,西普罗夫洛克萨辛和塞夫特里亚克松.
• 全基因组测序 (WGS) 用于遗传学分析和等离子体表征.
• 旅行史数据与基因组信息的整合,以了解孤立的相关性和传播.

主要成果:

• 几乎一半的Shigella flexneri 2a分离物 (47.7%) 对亚齐胺素有抗性,超过一半 (50.7%) 对西普罗夫洛克萨有抗性.
• 显著的比例 (34.7%) 的抗阿兹胺素分离物也耐西,表明多药性耐药性.
• 大多数孤立病例 (83.6%) 和几乎所有抗阿兹胺素的病例 (97.2%) 来自男性,有些人报告国际旅行.
• 遗传学分析揭示了两大,男性占主导地位的阿兹胺抗性分离物群,有证据表明潜在的进口和社区传播,可能与与男性发生性关系的男性 (MSM) 社区有关.

结论:

• 在安大略省出现和持续传播抗阿齐思罗米辛和素耐药的Shigella flexneri 2a菌株,主要影响男性.
• 塑体传播的抗药性基因的存在突显了对管理石病的公共卫生问题,特别是在高风险社区.
• 基因组监测与旅行和临床数据相结合,对于了解耐药性传播和实施有效的公共卫生干预措施来预防未来的疫情至关重要.