优化全幻灯片成像扫描设置用于计算机视觉,使用人类肺癌组织

科学领域:

• 数字病理学数字病理学
• 计算病理学计算病理学
• 组织病理学成像成像

背景情况:

• 数字病理学可以通过整个幻灯片图像 (WSIs) 来对瘤组织进行高级分析.
• 准确的图像质量和一致性对于可靠的临床和亚临床特征识别至关重要.
• 平衡图像生成时间与数据量是关键的挑战.

研究的目的:

• 为了确定最佳的ZEISS Axio Scan.Z1仪器设置,以生成具有代表性的病理组织图像.
• 评估不同扫描参数对图像可复制性和分析的影响.

主要方法:

• 使用各种ZEISS Axio Scan.Z1设置扫描H&E染色组织样本.
• 使用StarDist. 在生成的WSIs上执行核心细分.
• 使用匹配算法对复制扫描中的核检测和信息进行比较.

主要成果:

• 在扫描之间观察到高的一般匹配百分比.
• 然而,复制扫描之间核级信息的相似性相对较低.
• 扫描时间和数据量增加并没有改善复制品之间的相似性.

结论:

• 最佳的扫描设置平衡了与低吞吐量时间一致的性能.
• 更快的扫描参数可以为数字病理学分析提供可重现的结果.
• 这项研究有助于标准化WSI获取以获得可靠的下游AI和空间统计数据.