在多个解剖部位中对SIV特异性CD8+T细胞进行多个omics分析

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 病毒学 病毒学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• CD8+ T 细胞对于控制像SIV.这样的病毒感染至关重要.
• 之前的工作在SIV特异性CD8+T细胞中确定了组织特异性和共享的T细胞受体 (TCR) 序列.
• TCR序列,解剖位置和细胞功能之间的关系尚不清楚.

研究的目的:

• 调查SIV Gag-CM9特异性CD8+ T细胞的解剖学定位或TCR序列是否与不同的转录组形状相关.
• 为了确定与SIV感染中CD8+T细胞介导的病毒控制相关的潜在转录途径.

主要方法:

• 单细胞RNA测序是在SIV感染 rhesus的血液,淋巴结,脏和肝脏中的SIV Gag-CM9表皮特异性CD8+T细胞上进行的.
• 分析包括感染进展的动物和在停止抗逆转录病毒治疗后控制SIV的动物.
• 用基因组丰富分析来比较转录资料.

主要成果:

• 根据解剖部位或TCR序列 (共享与组织特定) 发现CM9特异性CD8+T细胞没有明显的转录特征.
• 转录资料没有明确地与不同动物共享的克隆类型相关联.
• 与逐渐感染的动物相比,来自治疗后控制者的CM9特异性CD8+ T细胞在细胞激活通路中显示了丰富.

结论:

• 解剖部位和TCR序列不定义SIV特异性CD8+T细胞的明显的转录组特征.
• 来自病毒控制器的抗原特异性CD8+ T细胞中丰富的激活通路表明在SIV复制控制中发挥作用.
• 这项研究提供了对CD8+ T细胞介导的SIV.控制的见解.