组织特异性RNA-seq定义了在C. elegans中控制男性尾尖形态发生的基因
Karin C Kiontke1, R Antonio Herrera2, D Adam Mason3
1Department of Biology, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY 10003, USA.
Development (Cambridge, England)
|September 10, 2024
概括
DM-domain转录因子DMD-3控制了C. elegans中男性特有的尾尖形态发生. DMD-3 调节复杂的基因网络,影响未展开的蛋白质反应和皮质维护.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 在Caenorhabditis elegans中,男性特有的尾尖形态发生 (TTM) 是一个关键的发育过程.
- 已知DM-domain转录因子DMD-3可以调节TTM.
研究的目的:
- 为了识别男性TTM期间由DMD-3直接调节的基因.
- 阐明DMD-3控制的分子机制和基因网络.
主要方法:
- 激光切割的RNA测序 (RNA-seq) 的C. elegans雄性和雌性雌性动物尾尖.
- 野生类型和dmd-3突变雄性之间差异性基因表达的分析.
- 使用转录记者对候选基因进行验证.
主要成果:
- 在dmd-3突变雄性中鉴定了564个差异表达的基因,与野生型雄性和雌雄性相比.
- 在49个验证的基因中,26个基因表现出男性特异性或男性偏见的表达.
- 基因实体学丰富揭示了改变的未折叠蛋白质反应和皮质维护途径.
结论:
- DMD-3调节了一个复杂的,潜在的模块化基因网络,对男性TTM至关重要.
- 下游目标包括参与氏素合成和高压应激反应的途径.
- dmd-3突变体的转录特征类似于雌雄性动物的转录特征,这表明DMD-3在TTM的男性化中的作用.
