机器学习和归算来描述人类诺罗病毒基因型对二酸盐敏感性的特征
Allyson N Hamilton1, Flor Maes1,2,3, Génesis Yosbeth Chávez Reyes1,4
1Department of Food Science, Center for Food Safety, University of Arkansas System Division of Agriculture, 1371 West Altheimer Dr, Fayetteville, AR, 72704, USA.
Food and environmental virology
|September 11, 2024
概括
人类诺罗病毒 (HuNoV) 对二酸盐 (NaOCl) 的敏感性因基因型而异. 一些基因型很快被禁用,而另一些需要更长的接触时间才能有效消毒,这会影响食品安全协议.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 食品安全科学 食品安全科学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 人类诺罗病毒 (HuNoV) 是导致食物传播疾病和全球性胃肠炎的主要原因.
- 由于HuNoV的低感染剂量和环境持久性,有效的消毒是至关重要的.
- 低酸 (NaOCl) 是HuNoV在表面上的常见消毒剂.
研究的目的:
- 评估来自基因组I,II和IV的11种HuNoV基因型对悬浮中NaOCl的敏感性.
- 为了确定NaOCl度和暴露时间对HuNoV无活化的影响.
- 为公共卫生和食品安全提供优化消毒策略的信息.
主要方法:
- 在pH值7.0-7.5下,HuNoV菌株在不同的NaOCl度 (50-150ppm) 中进行了化,1分钟和5分钟.
- 使用RNase预处理,然后通过RT-qPCR量化病毒失活.
- 统计分析,包括归算和机器学习,用于数据解释.
主要成果:
- 在所有测试的HuNoV基因型中,NaOCl降低了病毒载荷,有效性有显著差异.
- 基因型GI.1,GII.4新奥尔良和GII.4悉尼显示最低的敏感性.
- GII.6和GII.13是最容易受到影响的;高于0ppm的NaOCl度显示出统计学上类似的无活化,暴露时间的影响最小.
结论:
- HuNoV基因型显著影响对NaOCl消毒的敏感性.
- 根据特定的基因型优化NaOCl度和接触时间对于有效控制至关重要.
- 这些发现支持加强公共卫生和食品安全措施,防止诺罗病毒爆发.


