在棉花叶卷Multan病毒感染的棉花植物上培养的白的比较转录组分析
Ting Chen1, Yanbo Jia1, Jie Chen1
1Guangdong Provincial Key Laboratory of High Technology for Plant Protection /Plant Protection Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, China.
Frontiers in veterinary science
|September 12, 2024
概括
与非传染性地中海白相比,亚洲II-7白传播棉花叶卷曲穆尔丹病毒 (CLCuMuV) 显示出明显的基因表达变化. 这揭示了昆虫与病毒相互作用的分子差异.
科学领域:
- 植物病毒学 植物病毒学
- 昆虫分子生物学 昆虫分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 棉花叶曲线穆尔丹病毒 (CLCuMuV) 是南亚棉花的一个重要病原体.
- CLCuMuV的传播是由白 (Bemisia tabaci) 介导的,在神秘物种中具有不同的载体能力.
- 亚洲II-7白传播CLCuMuV,而地中海 (MED) 白没有,这表明潜在的遗传差异.
研究的目的:
- 调查亚洲II-7和MEDBemisia tabaci在接触CLCuMuV感染植物后的转录组反应.
- 识别与免疫和代谢途径相关的差异表达基因 (DEGs) 在具有不同载体能力的白物种中.
- 阐明贝戈莫病毒与白相互作用背后的分子机制.
主要方法:
- 在48小时获取访问期 (AAP) 后,在亚洲II-7和MED B. tabaci上使用Illumina测序进行转录组分析.
- 差异基因表达分析以确定病毒性和非病毒性白群体之间的DEG.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 分析途径,以对DEGs进行分类.
- 识别关键的基因家族,如zf-C2H2转录因子和cathepsin生物合成基因.
主要成果:
- 在亚洲II-7和MED B. tabaci分别发现了14213个和8986个DEG.
- 与亚洲II-7相比,MED白表现出较少的免疫和代谢相关的DEG.
- 在这两种物种中,zf-C2H2家族转录因子是最丰富的DEG.
- 病毒性亚洲II-7与病毒性MED白相比,显示出与cathepsin生物合成相关的DEG显著更多.
结论:
- 在CLCuMuV传播 (亚洲II-7) 和非传播 (MED) 的Bemisia tabaci神秘物种之间存在显著的转录组差异.
- 这些差异涉及免疫系统和代谢途径,为载体能力提供了洞察力.
- 这项研究提供了基础数据,以了解贝戈莫病毒与白相互作用的分子基础以及载体特异性.
