德国户外养殖猪的胃肠道线虫根据便卵数和下一代测序 nemabiome 数据
Hannah R M Fischer1,2, Jürgen Krücken1,2, Stefan Fiedler3
1Institute for Parasitology and Tropical Veterinary Medicine, Freie Universität Berlin, Robert-von-Ostertag-Str. 7, 14163, Berlin, Germany.
Porcine health management
|September 12, 2024
概括
在户外养的猪面临高线虫风险,包括Ascaris suum和Oesophagostomum dentatum. 经常清洁和避免进入牧场等管理实践可以显著减少猪的寄生虫感染.
科学领域:
- 兽医寄生虫学 兽医寄生虫学
- 动物健康 动物健康
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 在户外养的猪容易感染各种线虫感染,包括Ascaris suum,Oesophagostomum dentatum,Trichuris suis和肺.
- 此前还没有建立下一代测序方法来分析猪内生物组.
研究的目的:
- 通过使用FLOTAC和nemabiome分析,调查户外养殖的猪中胃肠道线虫和肺的流行情况.
- 通过调查问卷数据分析,识别与寄生虫发生和蛋强度相关的风险因素.
主要方法:
- 使用FLOTAC进行了线虫和肺的便卵数计.
- 基于ITS-2基因区域metabarcoding的 Nemabiome 分析被用于区分强基类物种.
- 对调查问卷数据的混合效应回归分析确定了潜在的风险因素.
主要成果:
- 在17个农场中,在15个农场检测到了虫蛋,其中最常见的是Ascaris suum (82%),strongyles (70%) 和Trichuris suis (35%).
- 纳米生物组分析发现了Oesophagostomum dentatum (93.9%),Oesophagostomum quadrispinulatum (5.9%) 和Globocephalus urosubulatus (0.1%). 它们是最常见的一种.
- 频繁清洁 (每周两次与每周一次),放牧场接入,以及深层垃圾/自由放牧系统与感染风险增加有关.
结论:
- 在德国户外养殖的猪中,Ascaris suum,Oesophagostomum spp.,Trichuris suis,Metastrongylus spp.和Globocephalus urosubulatus是最常见的.
- 这项研究首次在欧洲的家猪中报告了Globocephalus urosubulatus.
- 甲基编码是猪内生物组分析的合适工具,管理实践可以减轻寄生虫感染风险.
