多omics分析揭示了左侧和右侧结肠癌中瘤微环境的景观

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 左侧结肠癌 (LCC) 和右侧结肠癌 (RCC) 呈现出不同的临床和分子特征.
• 这些差异表明瘤微环境 (TME) 的变化可能会影响免疫治疗的疗效.

研究的目的:

• 调查LCC与RCC中TME的组成部分和特征差异.
• 了解TME变异如何影响治疗反应.

主要方法:

• 多omics分析包括散装RNA测序 (散装RNA-seq),单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和整个外因子测序 (WES).
• 解构算法和细胞间通信分析.
• 免疫光和流细胞计.

主要成果:

• 在LCC和RCC之间透的免疫细胞 (树突细胞,中性粒细胞,NK细胞,CD4/CD8T细胞,M1巨细胞) 的显著差异.
• 与LCC相比,RCC的突变频率更高 (P < 0.01).与LCC相比,RCC的突变频率更高 (P < 0.01).
• RCC瘤表现出增强的增殖潜力,增加的MHC I类表达,以及耗尽/激活的CD8+ T细胞 (CTLs),具有更大的瘤细胞相互作用.

结论:

• RCC表现出一种更具免疫性的TME,其特征是瘤特异性CTLs.
• 具有这些TME特征的RCC患者可能更受益于免疫检查点抑制剂治疗.