在Rhodopsin染色体中通过脊柱修改调整两光子吸收:CC2和TD-DFT讲述的故事
Saruti Sirimatayanant1, Tadeusz Andruniów1
1Institute of Advanced Materials, Department of Chemistry, Wroclaw University of Science and Technology, Wyb. Wyspiańskiego 27, Wrocław 50-370, Poland.
Journal of chemical theory and computation
|September 13, 2024
概括
在11-cis-视网膜质子化希夫基 (RPSB) 染色体上的甲基显著调整了两光子吸收 (2PA) 的强度. 甲基化,特别是在C13中,增强了2PA,趋势与双极矩变化相关.
科学领域:
- 计算化学计算化学
- 光物理学的光学物理学
- 分子光谱学 分子光谱学
背景情况:
- 罗多普辛的染色体,11-cis-视网膜质子 Schiff 基 (RPSB),在视力中起着至关重要的作用.
- 了解二光子吸收 (2PA) 特性对于光化学和生物物理学中的应用至关重要.
- 调整色素的2PA强度可以通过结构修改来实现.
研究的目的:
- 系统地调查甲基组模式如何影响RPSB的两光子过渡强度 (δ2PA) 和2PA截面 (σ2PA) 的影响.
- 通过甲基化诱导的结构变化与过渡二极极时刻和永久电二极时刻的变化相关联.
- 评估各种密度函数理论 (DFT) 函数的性能,以预测该系统中的2PA属性.
主要方法:
- 采用了对身份合集群近似二级 (RI-CC2) 方法的分辨率,采用了 aug-cc-pVDZ 基础集.
- 计算了七种甲基化RPSB类型的δ2PA,过渡二极点和永久电二极点.
- 对RI-CC2结果进行了四个DFT函数 (M11,MN15,CAM-B3LYP,BHandHLYP) 的评估.
主要成果:
- 甲基的位置和数量,以及二面曲线,显著决定了2PA的大小.
- 在δ2PA增强和平面RPSB5.5中存在C13-甲基组之间存在强烈的相关性.
- δ2PA趋势与S0-S1激发时的永久二极极矩的变化密切相似.
- 在DFT方法中,M11函数表现最好,尽管它低估了2PA值,而RI-CC2.
结论:
- 甲基化模式提供了一个可行的策略来调整RPSB的2PA特性.
- 激发时永久二极极矩的变化是预测2PA趋势的关键指标.
- 虽然M11是用于2PA预测的有希望的DFT函数,但对于定量准确性可能需要进一步细化.
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