在巴西患者中通过大规模并行测序对糖尿病的诊断
Rafael Hencke Tresbach1, Fernanda Sperb-Ludwig1, Rodrigo Ligabue-Braun2
1BRAIN Laboratory (Basic Research and Advanced Investigations in Neurosciences), Hospital de Clínicas de Porto Alegre, Porto Alegre, RS, Brazil; Graduate Program in Genetics and Molecular Biology, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, RS, Brazil.
巴西患者的糖尿病 (MSUD) 分子诊断是使用基因组和大规模并行测序来实现的. 这种具有成本效益的方法确定了25种致病变体,其中包括9种新型变体,有助于了解MSUD的遗传基础.
科学领域:
- 遗传学和基因组学 在
- 代谢障碍 代谢障碍 代谢障碍
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 糖尿病 (MSUD) 是一种罕见的遗传代谢疾病,由编码分支链α-酸脱酶 (BCKDH) 复合体的基因中的双基致病变体引起.
- MSUD导致分支链氨基酸 (氨酸,单氨酸和氨酸) 及其有毒代谢物的积累,需要早期诊断和管理.
- 准确的分子诊断对于了解疾病机制和提供遗传咨询至关重要.
研究的目的:
- 在巴西患者中进行MSUD分子诊断,使用向基因面板和大规模并行测序.
- 在关键的MSUD相关基因 (BCKDHA,BCKDHB和DBT) 中识别致病变异.
- 描述新型变异并评估大规模并行测序对MSUD诊断的有用性.
主要方法:
- 使用Ion PGM Torrent服务器进行大规模并行测序 (MPS),目标基因面板覆盖BCKDHA,BCKDHB和DBT基因.
- 对18名巴西患者的分析,生物化学诊断为MSUD.
- 使用美国医学遗传学和基因组学学院的指导方针进行变异致病性评估,在某些情况下使用桑格序列测序进行确认.
主要成果:
- 在18名患者中,MPS在16名患者中成功识别了致病变体,其中13名患者检测到两种变体.
- 在这三种基因中,共发现了25种致病变体,其中大多数在BCKDHB基因中.
- 发现了9种新的致病变体 (3种在BCKDHA中,6种在BCKDHB中),分子建模表明BCKDH复合体功能受到干扰.
结论:
- 大规模并行测序与向基因面板是一种强大且具有成本效益的工具,用于在巴西患者中对MSUD的分子诊断.
- 鉴定新型变异扩大了MSUD已知的突变谱,并提供了对酶功能的洞察力.
- 这种方法促进了准确的遗传诊断,这对于患者管理和家庭遗传咨询至关重要.
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