鉴定与TCDD诱导的裂口口腔发育中的circRNA和lncRNA相关的竞争性内源性RNA网络
Zengli Yu1, Yaxin Zhang2, Guoxu Wang2
1Center for Clinical Single-Cell Biomedicine, Henan Provincial People's Hospital, People's Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou 450003, China; School of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou 450001, China.
Toxicology letters
|September 13, 2024
概括
2,3,7,8-四二二氧化 (TCDD) 暴露会通过破坏竞争的内源性RNA (ceRNA) 网络来诱导口腔裂. 特定的circRNA-lncRNA-miRNA通路被确定为 palatal 发育的关键调节者.
科学领域:
- 发育生物学是发展生物学.
- 分子生物学分子生物学
- 毒理学 毒理学 毒理学
背景情况:
- 2,3,7,8-四二二氧化 (TCDD) 是一种已知的致病原体,可以引起口腔裂.
- 竞争的内源RNAs (ceRNAs),包括循环RNAs (circRNAs) 和长非编码RNAs (lncRNAs),是基因表达的关键调节者.
- ceRNAs通过哪些精确的机制影响口腔发育,特别是对原体暴露的反应,需要进一步阐明.
研究的目的:
- 为了研究circRNAs和lncRNAs作为ceRNAs在TCDD诱导的小鼠口腔裂纹模型中的作用.
- 鉴定TCDD暴露后参与 palatal 发育的失调 ceRNA 网络.
- 探索涉及TCDD诱导的形发生的分子途径.
主要方法:
- 在C57BL/6N怀孕小鼠中使用TCDD暴露的裂口口老鼠模型的构建.
- palatal shelves 的全转录组测序以识别差异表达的 circRNAs, lncRNAs, miRNAs 和 mRNAs.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
- 定量逆转录聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 用于验证.
主要成果:
- 观察到293个lncRNAs,589个circRNAs,47个miRNAs和138个mRNAs的显著失调.
- 亚利碳化合物受体 (AhR) 途径和细胞染色体P450 (CYP) 酶被确定为TCDD诱导的口腔裂的关键参与者.
- GO和KEGG分析表明TCDD对细胞内化合物代谢的影响,包括通过CYP酶对芳香化合物和药物代谢的影响.
- 两个特定的ceRNA网络,circRNA_1781/miR-30c-1-3p/PKIB和XR_380026.2/miR-1249-3p/DNAH10,被确定为口腔发育中的潜在枢纽.
结论:
- TCDD诱导的口腔裂涉及特定circRNA和lncRNA介导的ceRNA网络的失调.
- 已确定的ceRNA网络,circRNA_1781/miR-30c-1-3p/PKIB和XR_380026.2/miR-1249-3p/DNAH10,对于正常的 palatogenesis 具有潜在的关键性.
- 这些发现为了解裂的分子机制和开发有针对性的干预提供了基础.
