在动脉样硬化中对内皮细胞外囊泡进行转录组分析的新方案

科学领域:

• 心血管研究研究心血管研究
• 分子生物学分子生物学
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 动脉样硬化显著影响内皮健康,但缺乏直接内皮分析方法.
• 内皮细胞外囊泡 (EEVs) 具有识别分子特征和早期动脉样硬化生物标志物的潜力.
• 目前的诊断工具在检测内皮功能障碍的早期阶段方面存在局限性.

研究的目的:

• 建立和验证用于分离血EEV的方法.
• 在孤立的EEV上进行转录基因分析.
• 为了确定在动脉样硬化中内皮功能障碍的潜在早期生物标志物.

主要方法:

• 适应的抗体-磁珠免疫捕获用于血EEVs与控制体隔离,亚临床动脉样硬化和PAD受试者.
• 利用超低输入RNA-Seq方法对EEV进行转录基因分析.
• 进行生物信息学分析,将EEV转录组与内皮细胞进行比较,并确定差异表达基因 (DEG).
• 验证了UCP2作为血EV和体外刺激内皮细胞中的DEG.

主要成果:

• RNA-Seq分析确定了1667个在血EEV中富含内皮转录的基因.
• 在亚临床动脉样硬化和对照组之间发现了170个DEG,在PAD和对照组之间发现了180个.
• 与对照组相比,在两组动脉样硬化中确定了17种常见的DEG,包括UCP2.
• 证明IL-1β,TNFα,缺氧和oxLDL降低了内皮细胞中的UCP2表达.

结论:

• 成功建立了EEV分离和转录基因测序的协议.
• 开发的方法有望用于识别动脉样硬化中内皮功能障碍的早期标志物.
• 这种方法可能会导致新的诊断策略用于动脉样硬化检测.