多平行定量实时PCR的比较,针对不同的DNA区域,并在便中检测土壤传播的虫
Marina Papaiakovou1,2,3, Rubén O Cimino4,5, Nils Pilotte6,7
1Department of Biological Sciences, Smith College, Northampton, MA, 01063, USA. mpapaiakovou@gmail.com.
Parasites & vectors
|September 13, 2024
概括
定量实时PCR (qPCR) 能够有效地检测土壤传播的虫 (STH),即使在感染率较低的环境中. 不同的qPCR标与寄生虫数量有不同的相关性,表明需要标准化方法.
科学领域:
- 寄生虫学的寄生虫学
- 分子诊断学 分子诊断
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 土壤传播的虫 (STH) 影响全球18%的人口,造成严重的健康负担.
- 显微镜是标准的诊断方法,在患病率较低的地区缺乏灵敏度.
- 定量实时PCR (qPCR) 提供了更好的灵敏度,但缺乏标准化的目标.
研究的目的:
- 为了比较不同qPCR测定用于检测STHDNA的有效性.
- 评估qPCR结果与STH卵/幼虫数量之间的相关性.
- 评估现场样本中的不同qPCR目标之间的一致性.
主要方法:
- 具有已知STH数量的尖便样本使用qPCR试验进行了测试.
- 检测向的核糖体或非编码卫星DNA序列.
- 分析了现场采集的样本,以比较试验协议.
主要成果:
- 在Trichuris trichiura和Ascaris lumbricoides的qPCR和卵/幼虫数量之间观察到强烈的相关性.
- 对于Ancylostoma duodenale和Strongyloides stercoralis发现的相关性较弱,对于Necator americanus没有相关性.
- 在现场样本的qPCR测定之间,除了S. stercoralis.外,还发现了公平到中等的一致性.
结论:
- qPCR是STH的敏感诊断工具,即使在低强度感染中也是有效的.
- 选择的DNA目标影响寄生虫负担量化准确性.
- 需要进一步的研究来标准化qPCR标,以实现一致和准确的STH诊断.
