在头部和部的内微生物组 Paragangliomas
Maria Fedorova1, Anastasiya Snezhkina1, Dmitry Kalinin2
1Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, 119991 Moscow, Russia.
International journal of molecular sciences
|September 14, 2024
概括
这项研究揭示了在头部和部偏瘤 (HNPGLs) 中以前未被描述的微生物组. RNA测序确定了HNPGLs中的细菌家族,为瘤病原和潜在的微生物关联提供了新的见解.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部副瘤 (HNPGLs) 是一种罕见的,高度血管性瘤,未知微生物关联.
- 了解HNPGL微生物组对于阐明瘤病原性至关重要.
- 之前没有研究研究过HNPGLs中的微生物群.
研究的目的:
- 为了研究头部和部 paragangliomas (HNPGLs) 的微生物组合.
- 为了比较新鲜冷 (FF) 和甲固定嵌 (FFPE) HNPGL 组织之间的微生物发现.
- 为了确定HNPGLs中的细菌和病毒存在.
主要方法:
- 在29个新鲜冷 (FF) HNPGL组织上进行了16S rRNA基因测序.
- 微生物分析了82个甲固化嵌 (FFPE) HNPGL 的全转录组测序数据.
- 评估了来自实验室的候选污染物.
主要成果:
- 与FFPE HNPGLs相比,FF瘤中的细菌多样性明显较低.
- 16S rRNA测序发现了七个潜在的细菌家族:Bryobacteraceae,Enterococcaceae,Neisseriaceae,Legionellaceae,Vibrionaceae,Obscuribacteraceae和Mycobacteriaceae. 这七个细菌家族包括:
- RNA-Seq提供了更高的灵敏度,揭示了丰富的细菌家族,这些细菌家族与色细胞瘤,额外上腺瘤和质细胞瘤的细菌部分相关. 没有检测到任何病毒.
结论:
- 头部和部偏角瘤拥有独特的微生物群.
- 确定的细菌家族与其他神经内分泌瘤和质母细胞瘤中发现的细菌家族重叠.
- 这些发现有助于理解微生物组在HNPGL病原发生中的作用.
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