在现场采集的真菌标本中进行DNA条形码的最佳液体基DNA保存
Yu-Ja Lee1, Guan Jie Phang1, Che-Chih Chen2,3
1Department of Biomedical Science and Environment Biology, Kaohsiung Medical University, Kaohsiung, 80708, Taiwan.
Heliyon
|September 16, 2024
概括
RNAlater和DESS在现场有效地保护了真菌DNA. 当干燥步骤被包括在内时,RNAlater对于宏的DNA保存是优越的,确保了分子生态研究的更好的DNA质量和数量.
科学领域:
- 分子生态学分子生态学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 现场保存真菌DNA对于生物多样性和社区研究至关重要.
- 为了准确的分子生态研究,需要有效的DNA保存方法.
研究的目的:
- 系统地比较RNAlater和DESS在现场条件下保存大真菌DNA.
- 为了评估干燥步骤对DNA保存有效性的影响.
主要方法:
- 在不同温度和持续时间下,在RNAlater和DESS中保存的两种真菌物种进行了受控实验.
- 在RNAlater和DESS中保存的160个配对的宏真菌标本的现场采集.
- 使用统计分析 (t 测试) 进行DNA提取,质量和数量评估.
主要成果:
- 在受控环境中,RNAlater和DESS都显示出真菌DNA保存的可行性.
- RNAlater在现场采集的样本中显示出更高的成功率和更好的DNA质量/数量,特别是在干燥阶段.
- 现场样本的RNAlater和DESS之间观察到DNA质量和数量的显著差异.
结论:
- 无论是RNAlater还是DESS都适用于现场DNA保存.
- 在结合干燥步骤时,RNAlater是宏真菌DNA保存的首选方法.
- 这些发现支持在生态研究中为真菌DNA保存策略做出明智的选择.


