在基因小麦中MATE基因家族的分子水平上的结构和功能表征

科学领域:

• 植物分子生物学 植物分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 生物化学 生物化学

背景情况:

• 多种药物和潜在有毒挤出 (MATE) 基因编码的载体对于细胞排毒至关重要,在所有生物体.
• 这些载体去除重金属,异生菌和其他有毒物质.
• 在植物MATE基因家族的基分析仍然有限.

研究的目的:

• 在植物中对MATE基因家族进行全面的in silico表征.
• 为了确定潜在的MATE基因用于标记器辅助或转基因育种.
• 在各种压力条件下调查MATE基因的表达模式.

主要方法:

• 在MATE基因家族的基分析.
• 遗传学分析,以提出家族和子家族.
• 蛋白质与蛋白质相互作用研究.
• 来自小麦表达浏览器和谷物守护器工具的基因表达数据的分析.
• 构建三元图片来分析在生物和非生物压力下的表达.

主要成果:

• MATE基因家族被分为两个家族和七个子家族.
• 特定的MATE基因 (例如,TraesCS1D02G030400,TraesCS4B02G244400,TraesCS1A02G029900) 被确定为有毒化学物质运输的潜在重要基因.
• 在MATE基因 (1至14个外显子) 中,外显子数量有显著的变化.
• 大多数MATE基因在生物压力下表现出改变,其中TraesCS5D02G355500表现出高表达.
• TraesCS5B02G326600.1在Fusarium头炎感染期间表达最高.
• 44%的基因表达三胞胎在压力下表现出不平衡的输出,表明组织特异性和强度.

结论:

• 这项研究为植物MATE基因家族提供了基础的in silico特征.
• 鉴定到的MATE基因具有开发改良作物品种,增强抗压能力的潜力.
• 表达分析揭示了MATE基因在植物对生物和非生物压力的反应中的重要作用.