大型抑郁症的基因年龄差距估计 (GAGE):一种使用基因表达的处罚生物年龄模型

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 精神病学是一个精神病学.
• 衰老研究研究 衰老研究

背景情况:

• 大型抑郁症 (MDD) 与过早衰老有关.
• 加快的生物衰老可以作为MDD易感性或与年龄有关的疾病风险的生物标志物.
• 以前的基因表达模型表明,与健康对照组 (HC) 相比,MDD个体的年龄差距更大.

研究的目的:

• 开发一种基于基因表达的简化模型来估计生物年龄差距,称为基因年龄差距估计 (GAGE).
• 调查该模型与MDD状态之间的关联.
• 探索MDD,时间年龄和生物衰老之间的关系.

主要方法:

• 对于基因选择,使用LASSO惩罚来创建具有21个基因的L-GAGE模型.
• 该模型是从未服用药物的MDD参与者和HC的RNA-Seq数据上训练的.
• 独立的微阵列数据用于验证,统计分析根据时间和性别进行了调整.

主要成果:

• L-GAGE模型显示MDD参与者的生物衰老较高,尽管最初没有统计学意义.
• 发现L-GAGE与MDD状态和二分化时间表年龄的相互作用之间存在显著的关联.
• 在单独的数据集上验证证了MDD患者的统计学上显著的生物年龄升高.
• 功能丰富分析突出了与传染病和SARS-CoV.相关的途径.

结论:

• L-GAGE模型提供了一种新的方法来评估MDD中的生物衰老.
• MDD与加速的生物衰老有关,特别是在考虑年龄相互作用时.
• 这些发现表明MDD,衰老和传染病途径之间的潜在联系.