单核多组学确定了Pick's和阿尔茨海默病的共享和独特的途径

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 基因组学就是基因组学.
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.

背景情况:

• 神经退行性疾病,特别是像皮克病 (PiD) 和阿尔茨海默病 (AD) 这样的病,涉及复杂的调节机制.
• 了解表观基因组变异对于阐明疾病进展和确定治疗点至关重要.

研究的目的:

• 调查PiD和AD的表观基因组变异,以确定关键的监管变化.
• 发现疾病丰富的非编码区域,转录因子 (TF) 结合差异及其向基因.
• 识别疾病特异性监管变化,如人体获得增强剂 (HGE),并使用功能基因组学验证发现.

主要方法:

• 在神经退行性疾病模型中进行比较表观基因组分析.
• 全基因组识别转录因子结合部位和非编码的调控元素.
• 精细地绘制AD风险位点和细胞类型特定增强剂分析.
• 预测的监管要素的基于CRISPR的功能验证.
• 开发一个交互式数据库来可视化单细胞监管网络.

主要成果:

• 在PiD和AD中确定了关键的监管变化和疾病丰富的非编码区域.
• 发现了与目标基因相关的全基因组TF结合差异,在神经元和质细胞中具有共同和独特的模式.
• 发现与E3无素结合酶UBE3A相关的远端HGE,表明疾病特异性调节.
• 精细映射的AD风险基因到富含微质增强剂的位置.
• 使用CRISPR切除验证了预测增强剂的功能作用.

结论:

• 表观基因组变化在陶氏病变的发病过程中起着重要作用.
• 特定的监管要素和TF约束模式的识别提供了潜在的治疗目标.
• 开发的交互式数据库有助于进一步研究神经退行症中单细胞调节网络.