关于使用环境DNA作为研究河流的操作方法的现有证据:一个系统地图和主题合成
R Cruz-Cano1,2, M Kolb3, R A Saldaña-Vázquez4
1Institute of Geography, National Autonomous University of Mexico, Circuito Exterior s/n, Ciudad Universitaria, Coyoacán, C.P. 04510, Mexico City, Mexico.
Environmental evidence
|September 18, 2024
概括
河流中的环境DNA (eDNA) 分析正在增长,这是下一代测序所推动的. 尽管河流有保护潜力,但研究显示,河流偏向于高收入国家,这凸显了全球扩张的必要性,以了解全球水生系统模式.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 分子生物学分子生物学
- 保护生物学 保护生物学
背景情况:
- 环境DNA (eDNA) 为河流保护提供具有成本效益的生物社区监测.
- 开发了一个系统的绘图协议,以评估河流中的eDNA研究,识别研究主题,偏见和知识差距.
研究的目的:
- 系统地绘制河流中eDNA的研究格局.
- 在eDNA河流研究中识别地理和分类学偏差.
- 发现河流eDNA应用中的信息缺口和潜在的研究机会.
主要方法:
- 应用了一个系统的地图协议,搜索文献数据库和搜索引擎的相关文献.
- 两阶段的选过程确保了符合资格标准的相关性和遵守.
- 关于研究国家,年份,分类学,测序平台和技术的数据被提取并编码为公共数据库.
主要成果:
- 2003年至2022年间发表的545项研究符合纳入标准,自2003年以来与NGS技术相关的研究显著增加.
- 鱼类,细菌和病毒是研究最多的分类群体,而真菌仍然不足.
- 研究集中在高收入国家 (美国,日本,中国,巴西,英国),数据可访问性有限 (42%的研究).
结论:
- 自2003年以来,eDNA方法已被应用于河流,最近的增长得益于下一代测序的进步和成本降低.
- 对高收入国家,特别是美国和欧洲的研究存在显著的偏见.
- 全球eDNA河流研究的扩展对于生成可比数据和了解全球水生系统反应至关重要.
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