中性细胞外细胞陷基因预测胃癌的免疫治疗反应
Ningjie Sun1, Junjie Jiang2, Biying Chen3
1Department of Gastrointestinal Surgery, Yiwu Central Hospital, Yiwu, China.
Heliyon
|September 19, 2024
概括
中性细胞外细胞陷 (NETs) 与胃癌的进展和免疫疗法反应有关. 一个与NET相关的新型签名准确地预测了患者的结果和胃癌免疫治疗的反应.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 中性粒细胞外细胞陷 (NETs) 在宿主防御,癌症发育和免疫系统功能障碍中发挥作用.
- 在胃癌 (GC) 瘤微环境 (TME) 中,NETs的具体参与尚未得到充分理解.
- 鉴定NET相关基因表达的特征对于理解GC病变发生和治疗反应至关重要.
研究的目的:
- 为了研究胃癌中NET相关基因的表达模式.
- 分析NET相关基因与临床病理特征,预后,TME特征和GC免疫治疗疗效之间的关联.
- 开发基于NET相关基因签名的免疫治疗反应预测模型.
主要方法:
- 来自多个GC队列的转录组和单细胞RNA测序数据的分析 (TCGA-STAD,GSE62254,GSE15459,GSE183904).
- 利用共识聚类来定义NET相关的分子亚型.
- 在免疫疗法队列中使用LASSO回归,ROC和卡普兰-梅尔分析构建和验证了一种NET相关的基因特征.
主要成果:
- 在GC中确定了两个不同的NET相关集群,具有不同的临床病理特征和预后.
- 与高NET相关的集群显示出更具攻击性的瘤行为,更糟糕的预后,并丰富了TME免疫透和效应器功能.
- 开发的NET相关签名在预测免疫治疗反应 (AUC=0.939) 和治疗患者的良好预后方面表现出高准确性.
结论:
- 与NET相关的签名作为可靠的生物标志物,用于预测胃癌中免疫疗法的疗效.
- 这种签名可以帮助临床医生为GC患者选择适当的免疫疗法策略.
- 了解NET在GC TME中的作用为癌症进展和治疗提供了新的见解.
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