滴滴数字PCR用于精确量化贝类人类诺罗病毒与胃肠炎相关的疾病
Daniel Rexin1, Laetitia Kaas1, Jérémie Langlet1
1Institute of Environmental Science and Research Limited (ESR), Enteric, Environmental and Food Virology Laboratory, Porirua, New Zealand.
Journal of food protection
|September 19, 2024
概括
贝类中的诺罗病毒污染是一个全球性问题. 使用RT-数字滴滴PCR (RT-ddPCR) 的精确测量有助于评估风险,并为双贝类贝类的安全指南提供信息.
科学领域:
- 食品安全 食品安全
- 微生物学 微生物学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 诺罗病毒是全球病毒性胃肠炎的首要原因,经常与食物传播的疫情有关.
- 过的贝类可以从受污染的水中积累诺罗病毒,由于生食或轻度食而构成风险.
- 贝类污染对海鲜产业产生经济影响,并对公众健康构成挑战.
研究的目的:
- 为了精确量化贝类中诺罗病毒度,涉及到人类疾病.
- 评估RNase治疗对诺罗病毒RNA去除的有效性.
- 为改善风险评估和贝类消费安全指南提供数据.
主要方法:
- 在20个贝类样本中利用逆转录数字滴滴PCR (RT-ddPCR) 进行准确的诺罗病毒量化.
- 通过RT-定量PCR (RT-qPCR) 证实样本对诺罗病毒基因组I (GI) 和/或II (GII) 呈阳性.
- 评估RNase治疗在提取前对病毒RNA水平的影响.
主要成果:
- 诺罗病毒GI和/或GII度在44至4630个基因组拷贝 (GC) /g消化组织之间.
- 很大一部分 (40%) 的样本含有不到200 GC/g的诺罗病毒.
- RNase治疗使诺罗病毒GC/g度在GI中平均降低37.1%,在GII中降低19.4%.
结论:
- RT-ddPCR提供精确的诺病毒定量,对于贝类风险评估至关重要.
- 这些发现凸显了在贝类中建立普遍安全的诺罗病毒值方面的挑战.
- 数据支持对当前安全指南的评估,并为公共卫生战略提供信息.
