快速实时PCR测定检测Microdochium paspali导致海paspalum上的稀疏叶片和环境样本中的稀疏叶片
Yixuan Kong1, Peiyuan Jin1, Chenchen Jia1
1College of Agro-Grassland Science, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China.
Pest management science
|September 20, 2024
概括
一种新的实时定量PCR (qPCR) 方法快速检测Microdochium paspali,这种真菌导致海paspalum的稀疏叶片. 这种测试可以在植物和环境样本中早期检测疾病,以改善管理.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子诊断学 分子诊断学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
背景情况:
- 稀疏的叶子补丁 (SLP) 显著影响了海边的paspalum,由真菌引起的Microdochium paspali.
- 目前的检测方法是缓慢和不可靠的,因为共存的真菌.
- 快速而准确的病原体鉴定对于有效的SLP疾病管理至关重要.
研究的目的:
- 开发一种快速,灵敏和特定的实时定量PCR (qPCR) 试验,用于检测Microdochium paspali.
- 为了验证测试对已知分离物和各种真菌病原体的性能.
- 评估测试在检测M. paspali在各种海paspalum组织和环境样本中的实用性.
主要方法:
- 开发一种实时qPCR试验,针对M. paspali. 的内部转录间隔器 (ITS) 区域.
- 对12种M. paspali分离物和30种其他真菌病原体进行测试,以测试试剂的特异性.
- 确定测试的检测极限,并在接种和现场采集的样本中量化M. paspali.
主要成果:
- 开发的qPCR测定准确检测出所有测试的M. paspali分离物,没有交叉反应.
- 该试验实现了低检测极限3.65 × 10^2副本/μL,并在1小时内完成检测.
- 在无症状和症状的海帕斯帕卢姆组织 (叶子,茎,根) 和根球土壤中检测到M. paspali,即使是注射后24小时.
结论:
- 成功开发了一种快速可靠的实时qPCR试验,用于检测M. paspali.
- 该测试能够在海和环境样本中早期检测稀疏的叶片.
- 这种工具对早期预警系统和改善SLP的管理策略有重大影响.
