探索雌激素内分泌干扰剂对宫癌进展的影响:转录组分析和预后模型开发

科学领域:

• 基因组学和生物信息学
• 环境健康 环境健康
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 宫癌是全球女性的重大健康问题.
• 雌激素内分泌干扰剂 (EED),如BPA和酸盐,已知对健康有影响,但它们在宫癌中的具体作用尚不清楚.

研究的目的:

• 通过转录基因分析研究EEDs在宫癌进展中的作用.
• 确定与宫癌中EED相关的差异表达的雌激素反应基因 (DERGs).
• 基于这些DERG,开发一个宫癌的预后模型.

主要方法:

• 癌症基因组图谱 (TCGA) 宫癌数据的生物信息分析.
• 从比较毒基因组学数据库 (CTD) 识别与ED相关的雌激素反应基因 (ERG).
• 使用limma包的差异表达分析,丰富分析,风险建模的LASSO回归,生物标志物的COX分析,免疫透的ssGSEA和分子对接的Autodock.

主要成果:

• 确定了217个DERG,与内分泌抵抗,雌激素信号传递和细胞循环途径有关.
• 基于DERG的预后风险评分和名谱准确预测了宫癌的预后,并作为独立的风险因素.
• 风险得分与瘤免疫微环境相关,SCARA3和FASN被确定为独立的预后因素,FASN显示强烈的结合EEDs.

结论:

• DERG可以形成可靠的预后模型,用于预测宫癌患者的整体存活率.
• 这项研究为EED如何影响子宫癌进展提供了新的见解.
• 环境因素,包括EED,被突出显示为与癌症风险和发展相关的因素.