在中枢神经系统血管床的体内内皮细胞转化体的相对分析

科学领域:

• 血管生物学 血管生物学
• 眼科医生 眼科 眼科
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 内皮细胞 (ECs) 呈现出组织特异性,具有明显的视网膜和胸膜血管床,在眼睛中发挥独特的功能.
• 这些血管床的功能障碍与各种视网膜疾病有关,需要对它们的生理和病理生理特征进行分子理解.
• 在眼睛中研究体内EC基因表达是具有挑战性的,因为对于转录组学来说,难以分离纯眼部EC种群.

研究的目的:

• 提出一种方法论和分析工作流程,用于比较体内内皮质细胞 (EC) 翻译组在不同组织 (胸膜,视网膜,大脑) 中.
• 为了方便EC基因表达的组织间比较,使用Cre诱导的NuTRAP流体构造与Tie2-Cre和Cdh5-CreERT2小鼠线.
• 为应对针对大规模转录学和了解眼血管床的纯眼部ECs隔离的挑战.

主要方法:

• 使用了可诱导Cre的NuTRAP结合构成性的Tie2-Cre和可诱导塔莫西芬的Cdh5-CreERT2内皮Cre小鼠线.
• 执行了TRAP-RNAseq来分离和分析从胆膜,视网膜和大脑中的内皮细胞的翻译组.
• 进行了EC转化体的组织间比较,并分析了差异表达基因 (DEG) 和它们相关的通路.

主要成果:

• TRAP-RNAseq丰富显示了组织特异性基因丰富和每个Cre线跨组织的差异性通路表示.
• 差异表达基因 (DEGs) 超过50%的重叠在配对的组织比较中观察到 (胸膜与大脑,胸膜与视网膜,大脑与视网膜).
• 途径分析表明,与Tie2-Cre相比,Cdh5-CreERT2模型可能会抑制骨髓细胞功能,这表明Cdh5-CreERT2.2具有更具体的EC向.

结论:

• 开发的工作流允许对内皮细胞翻译组进行强大的组织间比较.
• 选择Cre线对内皮细胞向的特异性产生影响,Cdh5-CreERT2显示出比Tie2-Cre.更精确的EC隔离.
• 这些发现强调了在选择CRE线用于不同血管床内内皮细胞研究时,实验和分析考虑的重要性.