一种色度反转录循环介导的同热放大方法,针对L452R突变检测SARS-CoV-2的Delta变种
Narin Thippornchai1, Sukanya Pengpanich2, Wansadaj Jaroenram2
1Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, 10400, Thailand.
Scientific reports
|September 20, 2024
概括
一种新的色度测定方法使用RT-LAMP针对L452R突变准确检测SARS-CoV-2Delta变种. 这种快速测试有助于监测COVID-19的传播和控制新出现的变种.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 诊断检测试验 诊断检测试验
背景情况:
- SARS-CoV-2 变种的出现,特别是三角洲变种,给全球健康和经济带来了重大挑战.
- 德尔塔变种的流行影响了COVID-19疫苗的有效性,需要快速检测和传播监测.
- 现有的诊断方法可能需要加强特定变异识别.
研究的目的:
- 开发和验证一种色度计反转录循环介导的同热放大 (RT-LAMP) 试验,用于特定检测SARS-CoV-2 Delta变种.
- 针对S基因中的L452R突变,以精确识别Delta变种.
- 提供一种快速且易于使用的诊断工具,以区分三角洲变种与其他SARS-CoV-2菌株.
主要方法:
- 开发一种针对L452R突变的色度测定RT-LAMP试验.
- 颜色测量检测通过从紫色到黄色的视觉颜色变化来表示.
- 使用特定的标准等离子体评估试验的检测极限 (LOD).
- 使用126个临床样本进行验证,与实时RT-PCR进行比较.
主要成果:
- 该试验表明,对于L452R突变,每次反应检测的95%检测极限为57个副本.
- 临床样本测试显示100%的特异性,97.06%的灵敏度和98.41%的准确性检测Delta变种.
- 该试验成功地将Delta变种与通用SARS-CoV-2菌株区分开来.
结论:
- 这种色度测量RT-LAMP试验是第一个专门区分SARS-CoV-2Delta变种的试验.
- 该测试提供了一种灵敏,特定和准确的方法,用于快速检测Delta变种.
- 该工具可以支持COVID-19监测,人口统计研究,以及对新出现的变种实施有效的控制措施.
