优化皮肤表面代谢:对采样方法,提取溶剂和分析技术的全面评估
Huizhen Chen1, Yu Chen2, Yi Zhou3
1Human Phenome Institute, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China; Greater Bay Area Institute of Precision Medicine (Guangzhou), School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China.
The Journal of investigative dermatology
|September 21, 2024
概括
标准化皮肤表面代谢学对于准确的生物学见解至关重要. 这项研究优化了方法,找到特定的带和溶剂组合,用于可靠的脂质和水溶性化合物分析,揭示宿主微生物相互作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物化学 生物化学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 皮肤表面代谢学为皮肤生物学和微生物与宿主相互作用提供了洞察力.
- 对于可复制的皮肤表面代谢学,缺乏标准操作程序.
- 采样材料,提取溶剂和贴带方法需要优化.
研究的目的:
- 为皮肤表面代谢学建立优化的标准操作程序.
- 评估不同的采样材料,提取溶剂,录音频率和分析技术.
- 确定皮肤表面代谢物之间的关联以及它们在宿主微生物相互作用中的作用.
主要方法:
- 系统评估各种采样材料 (例如,D-Squame D100带).
- 评估不同的提取溶剂 (例如,甲基三丁/甲醇).
- 优化皮肤带程序,包括带的频率和数量.
主要成果:
- 皮肤表面脂组学的最佳方法涉及D-Squame D100带和甲基 tert-butyl 以太/甲醇提取剂.
- 五个带带应用程序与一个带带提供足够的生物质,用于脂质分析.
- 对于水溶性化合物来说,最优的贴带程序是不同的.
- 鉴定了皮肤表面代谢物之间的关联,可能会影响微生物切割型.
结论:
- 为皮肤表面代谢学建立了优化的协议,提高了数据的准确性和可重复性.
- 证明了脂质和水溶性代谢物提取的特定最佳条件.
- 提供了关于皮肤表面代谢物在宿主微生物相互作用和微生物社区形成中的作用的见解.
