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Updated: Jun 12, 2025
03:36
Development of Compendium for Esophageal Squamous Cell Carcinoma
Published on: April 12, 2024
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血细胞因子模式作为食道状细胞癌的预后标志物,通过无监督集群分析
Cheng-Hsun Chuang1,2, Pei-Ming Huang3,4, Sung-Tzu Liang4
1Institute of Molecular Medicine and Bioengineering, National Yang Ming Chiao Tung University, Hsinchu, Taiwan.
Oncology
|September 22, 2024
概括
细胞因子概况,特别是介素33 (IL33) 和瘤亡因子-α (TNF-α) 水平,可以预测食道状细胞癌 (ESCC) 的预后. 无监督聚类确定了基于这些细胞因子表达的不同生存结果的不同患者群体.
科学领域:
- 免疫学和癌症研究
- 生物标志物发现发现
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 像TNF-α,IL6,IFN-γ,IL17-α和IL33这样的细胞因子在免疫反应中至关重要,可能会影响癌症预后.
- 在癌症中同时评估多种细胞因子预后影响的同时评估仍未得到充分研究.
- 食道状细胞癌 (ESCC) 的预后可能受到免疫系统组件的影响.
研究的目的:
- 研究关键细胞因子的表达与ESCC患者的预后之间的相关性.
- 根据细胞因子概况,对基于细胞因子概况的ESCC患者进行分层的无监督集群分析.
- 确定潜在的基于细胞因子的生物标志物来预测ESCC患者的结果.
主要方法:
- 使用高斯混合法 (GMM) 通过mclust R包进行无监督聚类,以根据细胞因子表达来分组患者.
- 分析了来自324名NTU患者 (4个群体) 和179名GSE53625患者 (3个群体) 的血和瘤细胞因子表达数据.
- 使用卡普兰-梅尔曲线并进行单变量/多变量考克斯回归分析,比较整体存活率 (OS) 和无进展存活率 (PFS).
主要成果:
- 基因转基因菌群集成功区分了细胞因子表达模式及其与临床结果的关联.
- 特定集群 (NTU-G3与NTU-G4) 在3年和5年的OS和PFS中显示出显著差异,NTU-G3表明预后较差.
- 较高的TNF-α和较低的IL33表达标志着预后较差的亚组 (NTU-G3),具有显著的统计差异 (TNF-α的p=0.0002,IL33的p<0.0001).
结论:
- IL33和TNF-α的血表达模式是预测ESCC预后的潜在便利生物标志物.
- 在多变量分析中,GMM聚类和瘤/节点 (T/N) 阶段被确定为独立的预后因素.
- 细胞因子表达特征为食道状细胞癌的预后景观提供了宝贵的见解.
