感兴趣的区域定位,组织储存时间和抗体结合密度 - - 是 GeoMx® 数字空间分析仪的技术说明
S Böning1, F Schneider1, A-K Huber1
1Molecular Urooncology, Department of Urology, University Hospital Heidelberg, Heidelberg.
Immuno-oncology technology
|September 23, 2024
概括
组织储存时间影响NanoString GeoMx®数字空间分析 (DSP) 结果. 最近的标本 (≤5年) 比较老的标本显示出更高的抗体结合密度 (ABD),影响了空间生物学研究.
科学领域:
- 空间生物学 空间生物学
- 瘤异质性 瘤异质性
- 数字空间配置文件 (DSP) 是指数字空间配置文件.
背景情况:
- 空间生物学使瘤异质性分析成为可能.
- 在NanoString GeoMx® DSP平台上分析组织中的蛋白质/mRNA.
- 档案的FPE组织是可用的,但固定/存储效应是未知的.
研究的目的:
- 评估组织固定位置对DSP抗体结合密度 (ABD) 的影响.
- 评估组织储存时间对DSP ABD的影响.
- 在DSP ABD上研究细分免疫细胞 (CD45+,CD8+) 的区域差异.
主要方法:
- 在49个前列腺癌和25个RCC标本中,瘤中心与外围的ABD比较.
- 在≤5岁的标本和>5岁的标本中分析了ABD.
- 分段的CD45+和CD8+细胞来评估区域的ABD.
主要成果:
- 在前列腺癌或RCC中,瘤中心和周边之间没有显著的ABD差异.
- 在最近的标本 (≤5年) 和较老的标本 (P=0.027) 中,ABD显著更高.
- 对于细分免疫细胞,RCC瘤外围的ABD较高的趋势,不具有统计学意义.
结论:
- 在NanoString GeoMx® DSP中,提供了针对瘤异质性的可靠数据.
- 组织存储时间是解释DSP结果的关键因素.
