自动化高通量生物性别识别从考古人类牙涂料使用向蛋白质组学
Claire Koenig1, Patricia Bortel2,3, Ryan S Paterson4
1Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Proteomics Program, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, 2200 Copenhagen, Denmark.
Journal of proteome research
|September 26, 2024
概括
这项研究提出了一种快速,标准化的蛋白质组学方法,用于从人类牙面膜中确定生物性别. 精简的工作流显著加快分析,使大规模的考古和法医调查.
科学领域:
- 生物地质化学生物地质化学
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 生物性别确定对于考古学和法医研究至关重要.
- 目前的蛋白质组学方法缺乏标准化,限制了它们在性别识别中的应用.
- 牙面膜为生物性别确定提供了可行的来源.
研究的目的:
- 引入基于质谱 (MS) 的简化工作流程,以使用人类牙面膜快速准确地确定生物性别.
- 提高蛋白质组学用于性别识别的吞吐量和定量性能.
- 开发一个用户友好的数据分析管道来确定性别.
主要方法:
- 最少侵入性酸蚀刻用于牙面膜采样.
- 快速在线液态色谱 (LC) 与高分辨率并行反应监测 (PRM) 试验相结合.
- 精简的数据分析管道集成到一个闪亮的界面.
主要成果:
- 实现了每天200个样本 (SPD) 的吞吐量,具有高的定量性能.
- 在已知性别的现代和落叶牙上成功验证了该方法.
- 对300多名考古学家进行了测试,证明了可扩展性.
结论:
- 开发的基于MS的工作流提供了前所未有的性能和可扩展性,用于生物性别确定.
- 与传统的蛋白质组学方法相比,这种方法加速了分析的十倍.
- 能够对整个人口进行大规模的考古和法医研究.
关键词:
考古学 考古学 考古学 考古学生物学上的性别.牙的牙质是指牙上的牙质.法医医学 在法医医学上.高通量的高通量古代蛋白质组学的古生物学.平行反应监测 (PRM) 是指对反应进行平行监测.蛋白质组学 蛋白质组学
