可靠的雌激素相关的预后签名对于子宫体内膜异位癌
Mojuan Li1, Shuai Wang2, Hao Huang3
1Department of Obstetrics and Gynecology, the First Affiliated Hospital of Jinan University, Guangzhou, Guangdong 511500, China; Department of Obstetrics and Gynecology, the Sixth Affiliated Hospital, South China University of Technology, Foshan, Guangdong 528000, China.
Computational biology and chemistry
|September 26, 2024
概括
一个新的8基因风险评分有效预测子宫体内膜异位癌 (UCEC) 的预后. 高风险的UCEC患者面临较差的生存率,突出显示了这些雌激素相关基因 (ERG) 对患者结果的重要性.
科学领域:
- 妇科瘤学 妇科瘤学
- 癌症基因组学 癌症基因组学
- 分子病理学分子病理学
背景情况:
- 子宫体子宫内膜癌 (UCEC) 是一种流行的妇科癌症.
- 雌激素暴露是UCEC发展的重要风险因素.
- 识别受雌激素影响的关键基因对于理解UCEC病原体至关重要.
研究的目的:
- 确定与UCEC相关的关键雌激素相关基因 (ERG).
- 开发基于ERG的UCEC患者的预后模型.
- 研究ERG,预后和瘤免疫微环境之间的关系.
主要方法:
- 利用了来自GEO和TCGA的UCEC scRNA-seq和大量RNA数据.
- 与8734个ERG进行了差异表达和交叉分析,以确定候选基因.
- 采用单变量,LASSO和多变量考克斯回归分析来建立预后风险得分.
- 进行了GO,KEGG和GSVA丰富分析以获得功能洞察力和CCK8测定药物敏感性.
主要成果:
- 在UCEC中鉴定出86个差异表达的ERG,富含免疫和微生物群通路.
- 开发了一个具有显著预测能力的8ERG预后风险评分 (GAL,PHGDH,SLC7A2,HNMT,CLU,AREG,MACC1,HMGA1).
- 高风险得分与较低的患者存活率和独特的瘤免疫微环境相关.
- 较高的HMGA1表达表明对Osimertinib的敏感性增加.
结论:
- 基于8-ERG的风险评分显示了UCEC患者的良好预后价值.
- 高风险的UCEC患者表现出明显较差的生存结果.
- 瘤免疫微环境特征根据UCEC预后不同.
