相关实验视频
Updated: Jun 12, 2025
08:25
Identification of Circular RNAs using RNA Sequencing
Published on: November 14, 2019
12.2K
使用合成循环RNA尖端插入 (SynCRS) 来规范循环RNA测序数据
Vanessa M Conn1, Ryan Liu1, Marta Gabryelska1
1Flinders Health and Medical Research Institute, Flinders University, College of Medicine and Public Health, Bedford Park, South Australia, Australia.
Nature protocols
|September 26, 2024
概括
合成循环RNA (SynCRS) 的开发是为了准确量化RNA测序数据中的循环RNA水平. 这种方法解决了在不同样本和实验中比较循环RNA丰度的挑战.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 高通量RNA测序对转录组学至关重要.
- 循环RNAs (circRNAs) 是一种替代拼接RNA分子的类别.
- 由于技术错误,在RNA测序库中对circRNA进行量化和比较具有挑战性.
研究的目的:
- 开发一种可靠的方法来准确量化和比较circRNAs.
- 引入合成circRNA尖端插入 (SynCRS) 用于校准circRNA丰度.
- 为集成SynCRS到各种下一代测序工作流提供一个协议.
主要方法:
- 合成circRNA尖端插入 (SynCRS) 的开发.
- 在图书馆准备之前,将SynCRS添加到RNA样本中.
- 将SynCRS集成到高通量RNA测序和生物信息学管道中.
- 一步一步的SynCRS生成和尖端静脉测量协议.
主要成果:
- 在图书馆准备之前,可以将SynCRS添加到RNA样本中.
- 通过SynCRS,可以对各种样本,组织,物种和实验室的circRNA丰度进行定量校准.
- 该协议可适应所有下一代测序工作流程.
结论:
- SynCRS为准确的circRNA量化提供了一个强大的解决方案.
- 这种方法克服了比较circRNA表达数据的局限性.
- 该协议可用于具有基本分子生物学和生物信息学经验的用户.
更多相关视频
04:58Author Spotlight: Investigating the Role of Repetitive DNA Misregulation in Cancer Initiation and Immunotherapy Resistance
Published on: December 13, 2024
2.2K
00:09A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools
Published on: August 21, 2019
7.3K
