将基于NGS的血液感染识别与传统培养方法进行比较,以加强ICU护理:一项综合性研究

科学领域:

• 医学微生物学 医学微生物学
• 分子诊断学 分子诊断
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 在重症监护室 (ICU) 中,准确识别传染病至关重要.
• 如聚合酶链反应 (PCR) 和下一代测序 (NGS) 等分子技术已建立用于病原体检测.
• 传统的培养方法在识别所有致病原体,特别是非培养物种方面存在局限性.

研究的目的:

• 评估Bactfast和Fungifast (NGS基试验) 在ICU环境中的血液感染的诊断效用.
• 将这些NGS试验的性能与传统培养方法进行比较.
• 评估NGS的敏感性和特异性,以识别广泛的病原体,包括不可培养的病原体.

主要方法:

• 在一年内从ICU患者收集了500个血液样本.
• 进行了传统的血液培养,MALDI-TOF,VITEK®2紧系统以及基于NGS的Bactfast和Fungifast分析.
• 在所有方法中比较病原体识别结果.

主要成果:

• 传统培养检测到分别在26.8%和4.8%的样本中发现了细菌和真菌生长.
• 基于NGS的Bactfast在38.2%的样本中发现了细菌,其中包括33种不能培养的病原体.
• 基于NGS的Fungifast显示了与培养相比较的真菌检测率; *Candida albicans* 是最常见的真菌分离物.
• 确定的关键细菌病原体包括*Klebsiella pneumoniae*,*Enterococcus faecalis*和*Escherichia coli*. 这些病原体包括:

结论:

• 基于NGS的Bactfast和Fungifast在ICU患者中检测出各种细菌和真菌病原体时具有很高的灵敏度.
• 这些分子测试通过识别不可培养的有机体,优于传统的培养方法.
• 通过NGS进行快速和全面的病原体识别可能会提高ICU的临床结果.