PTMD 2.0:与疾病相关的翻译后修改的更新数据库
Xinhe Huang1, Zihao Feng1, Dan Liu1
1Department of Bioinformatics and Systems Biology, College of Life Science and Technology, Huazhong University of Science and Technology, Luoyu Road 1037, Wuhan 430074, China.
Nucleic acids research
|September 27, 2024
概括
本研究介绍了PTMD 2.0,这是一个全面的数据库,详细介绍了与人类疾病相关的翻译后修改 (PTM). 它提供了关于PTM疾病关联 (PDA) 的广泛数据,以推进这一关键领域的研究.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 基因组学和蛋白质组学
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 翻译后修改 (PTM) 对蛋白质功能和生物过程至关重要.
- 异常的PTM状态经常与人类疾病有关,突出显示了它们的病理意义.
研究的目的:
- 开发和介绍PTMD 2.0,一个与疾病相关的PTM综合数据库.
- 为分析PTM和人类疾病之间的复杂关系提供详细的资源.
主要方法:
- 在15105种蛋白质,93种PTM类型和2083种疾病中编制了342,624个PTM疾病关联 (PDA).
- 根据PTM状态变化 (上调,下调,缺席,存在,创建,破坏) 将PDA分为六类.
- 从101个资源中整合了广泛的注释,涵盖了各种生物和与疾病有关的方面.
主要成果:
- PTMD 2.0 包含一个大规模的 PDA 数据集和详细的注释.
- 该数据库整合了多方面的信息,包括蛋白质相互作用,功能注释和疾病关联.
- 该资源包含大约8GB的数据,提供了大量的分析量.
结论:
- 对于研究PTM和疾病的研究人员来说,PTMD 2.0是一个基本的资源.
- 该数据库有助于更深入地了解PTM在疾病发病过程中的作用.
- 这项免费的在线服务旨在加速PTM与疾病关系的生物医学研究.


