分析验证Esopredict,一个表观遗传预测试验的巴雷特食道患者的分析验证

科学领域:

• 胃肠病学 胃肠病学
• 分子诊断学 分子诊断
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 巴雷特食道 (BE) 是食道腺癌 (EAC) 的前体.
• 准确的风险分层对于管理BE患者和预防EAC进展至关重要.
• 现有的预测工具需要改进,以提高预测准确度.

研究的目的:

• 介绍ESOPREDICT的分析验证,这是BE的预后分析.
• 为了确定测试的性能特征,包括灵敏度,特异性,准确性,可重复性和可重复性.
• 为了确认Esopredict在风险分层的BE患者中对进展到高度发育不良 (HGD) 或EAC的实用性.

主要方法:

• 使用FFPE组织 (n=26),细胞系和DNA对照进行分析验证.
• 对分析灵敏度和特异性的检测极限 (LOD) 和空白极限 (LOB) 的确定.
• 评估测试间和测试内部的平均正数一致 (APA),平均负数一致 (ANA) 和精度 (变化系数,CV).

主要成果:

• LOD (1.5%的DNA甲基化) 显著高于LOB (0%的甲基化DNA).
• 观察到高的测试间和测试内APA (88%,94%) 和ANA (90%,94%) 值.
• 测试间和测试内CV<9%和<5%的精度非常高.

结论:

• 埃索普雷迪克特表现出强大的分析性能,证实了其敏感性和特异性.
• 该试验具有很高的可重现性和准确性,用于对BE患者的风险分类.
• 埃索普雷迪克特是一种可靠的预后工具,可以在5年内预测HGD或EAC的进展.