膜相关的s因子破坏了rRNA操作子在E.E.中的聚合. 大肠杆菌

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 遗传学 是一个
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 大肠杆菌中的染色体组织通过Hi-C.显示稀疏的长距离相互作用.
• 使用光显微镜和Mu转换观察了核糖体RNA (*rrn*) 操作子的空间共定位 ("聚类").
• 运算子集群的 * rrn * 机制主要通过 * cis * 作用元素来理解.

研究的目的:

• 为了确定涉及到*rrn*操作集群的*trans*作用元素.
• 调查细胞应激反应,特别是热冲击对*rrn*操作组织的作用.
• 阐明西格玛因子影响染色体聚类的机制.

主要方法:

• 通过化学和物理手段扰乱大肠杆菌.
• 在热冲击后对*rrn*操作子集群的分析.
• 过度表达特定的西格玛因子 (σ^H, σ^D, FecI) 并评估它们对集群的影响.
• 评估转录活动,核心-RNAP相互作用和DNA结合对 σ ^{H 抗聚类活动的作用.}

主要成果:

• 热冲击扰乱了 *rrn* 操作符的空间聚类.
• 仅仅西格玛H (σ^H) 的高表达就足以破坏*rrn*操作子集群,而不依赖于热应力.
• H的抗聚类活性需要核心-RNAP相互作用和DNA结合,但不需要转录活性.
• 过度表达FecI,ECF的西格玛因子,也会扰乱聚类,并被 σ^D 抑制,这表明核心RNAP的竞争.

结论:

• 西格玛因子,特别是 σ^H 和 FecI,在调节运算子集群方面发挥着重要作用.
• 不同的西格玛因子之间的核心RNA聚合酶 (RNAP) 竞争可能是影响染色体组织的关键机制.
• 与膜相关的西格玛因子可能参与E. coli*基因组内的遥远*rrn*位点的空间组织.