在各种动物物种中,PPARGC1A基因的适应性进化和功能意义
Seyed Mahdi Hosseini1, Farman Ullah1, Muhammad Zulfiqar Ahmad2
1National Center for International Research on Animal Genetics, Breeding and Reproduction (NCIRAGBR) College of Animal Science and Technology, Huazhong Agricultural University Wuhan China.
在脊椎动物中对PPARGC1A基因的进化分析显示,在特定的编码子中存在显著的积极选择,这表明了适应性进化. 这突显了基因的关键作用和不同物种的功能适应.
科学领域:
- 进化生物学是进化的生物学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子进化是分子进化的过程.
背景情况:
- PPARGC1A基因在代谢调节和细胞能量恒温中发挥着至关重要的作用.
- 了解它的进化轨迹是解读它在脊椎动物中的适应意义的关键.
研究的目的:
- 研究38种脊椎动物物种中对PPARGC1A基因起作用的进化模式和选择压力.
- 在积极或净化选择下识别特定的编码子,并了解它们的功能含义.
主要方法:
- 在447个位上使用最大概率 (MEGA) 的基于的进化分析.
- 应用互补的计算方法,包括IFEL,REL,FUBAR和SLAC.
- 整合混合效应建模 (MEME) 以检测情节性多样化选择.
主要成果:
- 在PPARGC1A编码子中确定了选择压力的显著变化.
- 4,11,66,123和特别是137的代显示出积极选择的证据 (dN-dS>1).
- 编码子30和90呈现出近乎中性的得分,这表明了净化选择,而MEME检测到了偶发的多样化选择.
结论:
- PPARGC1A基因在脊椎动物中经历了适应性进化,特定的部位经历了积极选择.
- 这些发现强调了该基因在多种脊椎动物血统中的功能重要性和适应性.
- 遗传学和域分析支持PPARGC1A基因家族内的保存特征和功能相互依赖.
更多相关视频
09:52Investigation of Beige Fat Biology and Metabolism Using the CRISPR SunTag-p65-HSF1 Activation System
Published on: January 6, 2023
03:58Generation of Brown Fat-Specific Knockout Mice Using a Combined Cre-LoxP, CRISPR-Cas9, and Adeno-Associated Virus Single-Guide RNA System
Published on: March 24, 2023
相关概念视频
Exon Recombination
Exon shuffling follows “splice frame rules.” Each exon...
Multi-species Conserved Sequences
Although the genome of each species varies greatly from each other, a few sequences are highly conserved. Such conserved...
Gene Duplication and Divergence
The duplicated copies of the gene are called Paralogs. Paralogs with similar sequences and functions form a gene family. Across several species, a large number of gene families are...
Gene Evolution - Fast or Slow?
In contrast, regions which code...
Cis-regulatory Sequences
GPCRs Regulate Adenylyl Cylase Activity
