杆转录基因组序列阅读档案用于检测野生和殖民地三虫群 (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae) 的病毒

科学领域:

• 关节动物传播的病毒
• 病毒学 病毒学
• 载体传播疾病 载体传播疾病

背景情况:

• 三原子是Trypanosoma cruzi的载体,这是查加斯病的原因.
• 气候变化和城市化正在扩大三胺范围,增加它们作为树冠病毒载体的潜力.
• 已知的三原子病毒组是有限的,以前仅记录了八种昆虫特异性病毒.

研究的目的:

• 用公开可用的转录组数据评估三原子虫的病毒多样性.
• 在三胺中识别已知和新型的树冠病毒,扩大对三胺病毒组的知识.
• 为了证明转录组数据挖掘在昆虫载体中发现病毒的实用性.

主要方法:

• 分析了来自8个物种和6个国家的野生和殖民地三原子的122个转录组数据集.
• 在数据集中的病毒序列的生物信息识别.
• 检测到的病毒的基因组测序和表征.

主要成果:

• 在三原子中检测到6种病毒,包括Rhodnius prolixus病毒4-6.
• 三胺病毒 (TrV) 在近一半的选三胺中被发现,在Triatoma brasiliensis和Mepraia物种中有新的报告.
• 梅科斯长阴茎病毒1和Drosophila melanogaster诺拉病毒首次在接吻虫中报告.

结论:

• 转录组数据挖掘是一种有效且低成本的方法,用于在三原子中发现树病毒.
• 这项研究显著扩大了三原子病毒的基因组资源.
• 三胺含有各种各样的病毒,突出了它们作为 arboviral 载体的潜力.