在循环的无细胞DNA中发现的5-氧甲基细胞素作为SLE潜在的诊断生物标志物
Xinya Tong1, Wenwen Chen1, Lele Ye2
1Wenzhou Collaborative Innovation Center of Gastrointestinal Cancer in Basic Research and Precision Medicine, Wenzhou Key Laboratory of Cancer-related Pathogens and Immunity, Department of Microbiology and Immunology, Institute of Molecular Virology and Immunology, Institute of Tropical Medicine, School of Basic Medical Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang, China.
Lupus science & medicine
|October 4, 2024
概括
这项研究揭示了系统性红斑狼 (SLE) 患者的无细胞DNA中5-甲基组 (5hmC) 的增加,确定了这种复杂的自身免疫性疾病的潜在诊断生物标志物.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 系统性红斑狼 (SLE) 是一种复杂的自身免疫性疾病,具有具有挑战性的诊断和以症状为重点的治疗.
- 表观遗传变化,特别是5-Hydroxymethylome (5hmC) 修饰,与SLE病变发生有关.
- 在SLE患者中,5hmC在循环无细胞DNA (cfDNA) 中的作用在很大程度上尚未被探索.
研究的目的:
- 调查SLE患者和健康对照者的cfDNA中的5hmC分布.
- 探索5hmC作为SLE的诊断标记物的潜力.
- 了解SLE中5hmC修改的调控机制.
主要方法:
- 使用5hmC-Seal.进行血cfDNA的全基因组5hmC分析.
- 生物信息学分析以确定差异基甲基化区域 (DhMRs).
- 在CCCTC-结合因子 (CTCF) 和TET蛋白的体外机制研究.
主要成果:
- 在SLE患者和HC患者之间观察到5hmC模式的明显差异,与疾病进展相关.
- 在SLE患者的cfDNA中检测到增加的5hmC丰富.
- 通过CTCF-TET相互作用调节的151个超-5hmC基因和特定生物标志物 (BCL2,CD83,ETS1,GZMB) 被确定.
结论:
- 血cfDNA中的5hmC增加与SLE疾病活性有关.
- 确定了与SLE相关的生物标志物和差异性基甲基化的区域,为SLE病原体提供了洞察力.
- 在关键的SLE相关基因的5hmC修饰中,CTCF起着调控作用.
