转移性尿路细胞癌的基因组和转录组景观
Yohann Loriot1,2,3, Maud Kamal4, Laurene Syx5
1Gustave Roussy, DITEP, Gustave Roussy, Villejuif, France. yohann.loriot@gustaveroussy.fr.
Nature communications
|October 4, 2024
概括
转移性尿路细胞癌 (mUC) 与初级UC具有共同的基因组特征. 关键发现揭示了流行突变特征,并在73%的患者中确定了可操作的目标,包括FGFR3和ERBB2的改变.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 在瘤学瘤学.
- 翻译研究是翻译研究.
背景情况:
- 转移性尿路细胞癌 (mUC) 具有有限的治疗选择.
- 对于非转移性UC存在基因组和转录组见解,但mUC仍然不清楚.
研究的目的:
- 阐明转移性尿路细胞癌的基因组和转录组景观.
- 在mUC患者中识别潜在的治疗点.
主要方法:
- 在111个转移性活检上进行全外体测序 (WES) 和mRNA测序 (RNA-seq).
- 与癌症基因组图谱 (TCGA) 主要UC数据进行比较.
- 使用共识转录组分类的分子亚型.
主要成果:
- 在mUC的基因组改变是可比的初级UC.
- 流行突变特征包括APOBEC (56%),白金 (14%) 和HRD (9%).
- 观察到神经内分泌亚型的丰富;注意到亚型异质性和时间演变.
- 在73%的患者中确定了可操作的目标:FGFR3 (26%),PIK3CA (13%),ERBB2 (7%),TSC1 (7%).
- 在各个亚型和转移部位中,NECTIN4和TACSTD2的表达率很高.
结论:
- mUC的基因组概况在很大程度上与原发性瘤一致.
- 分子亚型和特定变化的识别提供了治疗途径.
- 针对mUC的向治疗可以通过基因组和转录组分析进行指导.


