大湖地区高频率的阿尔特米西宁部分抗性突变通过快速聚合深度测序揭示了
Neeva Wernsman Young1,2, Pierre Gashema3, David Giesbrecht1
1Pathology and Laboratory Medicine, Brown University, Providence, Rhode Island.
The Journal of infectious diseases
|October 5, 2024
概括
在卢旺达和邻近的非洲国家,Plasmodium falciparum Kelch13 (K13) 突变赋予艺术素部分耐药性的突变正在迅速扩大. 这种传播威胁着疟疾控制工作,并可能导致伴侣抗药性.
科学领域:
- 疟疾学和热带医学
- 遗传学和基因组学 在
- 药物耐药性研究 药物耐药性研究
背景情况:
- 凯尔奇13 (K13) 561H突变是第一个在非洲发现的Plasmodium falciparum artemisinin部分耐药性标志物,于2014年首次在卢旺达检测到.
- 监测对于了解K13突变在卢旺达和邻近地区的传播至关重要.
研究的目的:
- 评估卢旺达和邻国K13突变和其他抗疟疾耐药性标志物的频率和地理分布.
- 评估液体血滴聚合测序对具有成本效益的抗药性监测的有用性.
主要方法:
- 利用新的液体血滴保存和聚合测序来快速评估抗性突变频率.
- 分析了来自卢旺达,乌干达,坦桑尼亚和刚果民主共和国的39个卫生机构的5,465个疟疾阳性样本 (2022年5月至2023年3月).
- 在199个池中测序样本以确定突变频率.
主要成果:
- 在卢旺达,K13 561H和675V突变是普遍存在的 (分别是90%和65%的地点).
- 高K13 561H频率在坦桑尼亚观察到,在乌干达频率较低 (1.6%),在刚果民主共和国没有.
- 候选突变 (441L,449A,469F) 与验证突变的同时发生表明共享的抵抗压力. 同时,还发现了高频率的抗甲-卢梅方丁和硫素-甲胺耐药性标志物.
结论:
- 凯尔奇13突变正在整个地区迅速传播,对疟疾控制构成重大威胁.
- K13突变的扩张可能会促进对抗疟疾药物的耐药性出现.
