基因组测序和采矿扩大了Lysobacter的天然产品目录

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 自然产品化学 自然产品化学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 生物是制药开发的关键来源.
• 以生物控制和抗生素生产而闻名的Lysobacter属是天然产品的研究不足的来源.
• 探索Lysobacter的生物合成能力可以产生新的化合物.

研究的目的:

• 通过基因组测序和采矿来研究Lysobacter物种的生物合成潜力.
• 在Lysobacter基因组中识别新型天然产品生物合成基因集群.
• 为了比较不同Lysobacter物种和菌株的生物合成能力.

主要方法:

• 对Lysobacter firmicutimachus和Lysobacter yananisis的基因组草案进行测序.
• 分析了113个公开可用的Lysobacter基因组,用于生物合成基因集群.
• 在24个选定的Lysobacter基因组上进行基因组挖掘,具有完整的组装和高基因群数.

主要成果:

• 确定了许多独特的生物合成基因:21个非核糖体,11个混合多基/非核糖体,4个多基和27个兰氏.
• 发现了生物合成潜力的广泛范围,其中物种含有1到近20个基因集群.
• 暂时确定了Lysobacter firmicutimachus.中的plusbacins生物合成基因集群.

结论:

• 莱索巴克特细菌拥有丰富且基本上没有特征的自然产品库.
• 在Lysobacter物种之间存在生物合成能力的显著差异.
• 生物合成能力在物种内部的变化是最小的,这表明物种内部的潜力得到保护.