权重基因共同表达网络分析和鉴定 ginsenoside 生合成候选基因,以治疗 MeJA 的 ginseng 偶然根

科学领域:

• 植物生物技术 植物生物技术
• 分子生物学分子生物学
• 药学认知是指药学上的认知.

背景情况:

• 人参 (Panax ginseng) 是一种有价值的药用草本,具有各种各样的药理作用,归因于人参.
• 甲基斯酸盐 (MeJA) 是一种诱导剂,用于增强生物反应器中向性金赛诺化物生产.
• 了解MeJA的分子机制对于优化人参酸生物合成至关重要.

研究的目的:

• 分析MeJA治疗持续时间对人参偶然根中的人参化物含量的影响.
• 通过转录组分析研究MeJA对与金氏化物生物合成相关的基因表达的影响.

主要方法:

• 人参的偶然根在不同的时间点被MeJA治疗.
• 使用分析方法量化了金色化物含量.
• 进行了转录组测序和差异基因表达分析.
• 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 进行了丰富分析.
• 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 用于识别基因模块.

主要成果:

• MeJA显著增加了亲生二醇和亲二醇人参化物 (Rg3,Re,Rf) 的含量.
• 总共有14009个差异表达的基因被确定.
• 丰富分析突出了与刺激反应,代谢过程和类/多基基类代谢有关的GO术语.
• 据WGCNA发现,两种基因表达模块与人参化物生物合成密切相关.

结论:

• 这项研究建立了一个参考系统,用于使用MeJA.
• 这些发现为未来研究MeJA调节的金氏化物生物合成提供了宝贵的遗传资源.
• WGCNA成功地确定了参与生物合成途径的关键基因模块.