现实世界泛瘤综合基因组分析样本充分性和组织和液体样本中的成功率

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 临床诊断 临床诊断 临床诊断

背景情况:

• 综合基因组分析 (CGP) 对精确瘤学至关重要.
• 基于组织和基于液体的CGP的成功率的现实数据有限.
• FoundationOne CDx (F1CDx) 和FoundationOne Liquid CDx (F1LCDx) 是广泛使用的CGP平台.

研究的目的:

• 评估基于组织的 (F1CDx) 和基于液体的 (F1LCDx) CGP的现实成功率.
• 在各种瘤类型中比较F1CDx和F1LCDx之间的样本充分性和测序成功.
• 确定影响成功率的因素,如瘤类型和瘤分数.

主要方法:

• 在临床护理中通过F1CDx和F1LCDx进行CGP的泛瘤队列的分析.
• 测序前样本的充分性和测序后的成功率的评估.
• 组织和液体样本之间的成功率的比较,重点是中枢神经系统 (CNS) 瘤和液体瘤分数 (TF).

主要成果:

• 对于F1CDx和F1LCDx,全瘤预测序列的充分性 (>90%) 高.
• 两个平台的中位数测序成功率都很高 (F1CDx:97.9%;F1LCDx:98.1%).
• 与F1LCDx相比,F1CDx在中枢神经系统瘤中显示出更高的样本充足度和成功率.
• 液体检测的成功受到瘤分数 (TF) 的显著影响,平均样本至高TF率为37.7%.

结论:

• 基于组织和基于液体的CGP在现实环境中表现出同样高的成功率,但不包括中枢神经系统瘤.
• 液体CGP的成功取决于达到足够的瘤分数.
• 这些发现有助于临床医生为癌症患者选择最佳的CGP测试策略.