用CRISPRmapmap映射多式现象型到细胞和组织中的干扰

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 细胞生物学 细胞生物学
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 遗传查的传统测序方法需要细胞溶解,限制了空间表型的分析.
• 光学聚合基因屏幕提供了一种方法来研究细胞对遗传干扰的反应,包括形态学和组织组织.
• 在不同的细胞类型和体内环境中研究空间表型仍然具有挑战性.

研究的目的:

• 开发一种多式光学聚合的CRISPR选方法,用于现场条形码读取.
• 能够在具有挑战性的细胞类型和体内环境中分析空间表型.
• 应用该方法来识别影响癌症治疗反应的致病突变.

主要方法:

• CRISPRmap将在现场的CRISPR指南识别条形码读取与多重免疫光和RNA检测相结合.
• 条形码检测通过DNA寡头的组合杂交来增强.
• 该方法允许在不同类型的细胞中进行in situ读取,包括初级细胞,干细胞,神经元和体内组织.

主要成果:

• 在以前无法访问的细胞类型和环境中,CRISPRmap成功启用了现场条形码读取.
• 乳腺癌细胞的检测显示了DNA损伤修复基因变异对癌症疗法的细胞反应的影响.
• 使用CRISPRmap的光学表型识别确定了可能的致病性患者衍生的突变,这些突变以前被归类为未知临床意义的变异.

结论:

• CRISPRmap是一个强大的多式查平台,用于现场基因扰乱分析.
• 该方法扩大了光学聚合选对各种生物系统的适用性.
• CRISPRmap在识别致病突变以改善癌症治疗选择方面具有临床意义.