从HIV感染的人性化小鼠模型中,FFPE脏组织的单细胞空间分析
Guoxin Wu1, Samuel H Keller2, Luca Sardo2
1MRL, Merck & Co., Inc, Rahway, NJ, USA. Guoxin_wu@merck.com.
Biomarker research
|October 8, 2024
概括
这项研究使用单细胞空间转录组学来识别潜在的潜伏HIV感染生物标志物. 在CosMx SMI平台上,艾滋病毒感染的细胞中腺氨酸激酶 (SYK) 的表达更高,为艾滋病毒储存库提供了新的见解.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 尽管有效的抗逆转录病毒疗法,但艾滋病毒潜伏期对治愈构成了重大障碍.
- 存在有限的生物标志物来识别由于病毒休眠的潜伏HIV感染细胞.
- 了解艾滋病毒的持续机制需要对个体感染细胞进行分析.
研究的目的:
- 探索HIV潜在的潜伏生物标志物.
- 调查维持艾滋病毒储存库的机制.
- 评估CosMx空间分子成像仪平台在艾滋病毒研究中的实用性.
主要方法:
- 在使用CosMx SMI.MI.的人性化小鼠模型中,对HIV感染细胞的单细胞空间转录基因分析.
- 在病毒性和病毒性样本中量化了超过一千个人类基因.
- 通过在人体 CD4+ T 细胞上使用 in situ 杂交,免疫组织化学和 qPCR 来证实研究结果.
主要成果:
- 感染艾滋病毒的细胞主要是分化的CD4+ T细胞.
- 病毒性样本显示出明显更多的感染细胞和HIV转录,而不是病毒性样本.
- 55个基因的表达在病毒感染细胞和病毒感染细胞之间有所不同,脏氨酸激酶 (SYK) 和CXCL17显著上调 (约1. 100倍) 在禽体样本中.
结论:
- 该CosMx SMI平台是有效的评估艾滋病毒感染和确定宿主生物标志物.
- 从人性化的小鼠模型中,在感染了aviiremic的细胞中SYK基因表达的升高与在人类CD4+T细胞中发现的结果一致.
- 这表明SYK可能是HIV储存库的潜在生物标志物.
